提高药效：肛门给药器可以将药物直接送入患者的直肠和结肠，这种给药方式可以绕过胃肠道的消化过程，使药物更快地被吸收，从而提高药效。

治疗疾病：肛门给药器常用于治疗直肠和结肠相关的疾病，如炎症性肠病、溃疡性结肠炎等。通过给药器，医生可以将药物直接送达患者的病灶部位，以达到治疗的目的。

镇痛和止血：肛门给药器也可用于给予镇痛和止血药物。例如，在直肠手术中，医生可以使用肛门给药器将止血药物送入直肠，以控制手术过程中的出血。

营养补充：肛门给药器还可以用于给予营养补充物，如肠外营养液。对于无法通过口服摄入足够营养的患者，肛门给药器可以提供必要的营养支持。

排便辅助：在某些情况下，肛门给药器也可以用于辅助排便。例如，对于严重便秘的患者，医生可以使用肛门给药器给予润滑剂或刺激性药物，以促进排便。

减少药物对肝脏的刺激：药物在直、结肠内吸收后可有50~70%不经过肝脏直接入血进入大循环，这样还可减少药物对肝脏的刺激，减轻肝脏负担。

避免药物对胃的直接刺激：经肛门给药却可免去药物对胃的直接刺激和精神负担。

避免药物被破坏：口服药后药物是受胃酸、消化道酶及肝脏解毒作用的破坏，使药物发生生物化学变化而药交降低。经肛门给药则避免了这些破坏，所以作用时间要比口服长，疗效要比口服好。

起效迅速：口服药要经上消化道和肝脏内旅行才能发挥药效，同时受糖衣、胶囊等剂型、食物种类和服药时间等干扰因素的影响，所以不如经肛门给药直接吸收作用迅速而生效快。

简便、安全：比起静脉输液有简便、安全、疗效大致相仿等优点，所以是纠正脱水、酸中毒及营养不良有效途径。